生物物理研究所的研究系统由六个实验室组成：生物大分子国家重点实验室、脑与认知科学国家重点实验室、中国科学院感染与免疫重点实验室、中国科学院核酸生物学重点实验室、蛋白质与多肽药物所重点实验室、交叉科学所重点实验室。

　　这六个实验室下设91个研究组，共有研究组长91人。

　　1、 生物大分子国家重点实验室

　　2、 脑与认知科学国家重点实验室

　　3、 中国科学院感染与免疫重点实验室

　　4、 中国科学院核酸生物学重点实验室

　　5、 蛋白质与多肽药物所重点实验室

　　6、 交叉科学所重点实验室

　　院士研究组长共有12人：

　　◆   院士研究组长

　　按研究组长姓氏首字母排列：

　　◆   姓氏首字母A-G           ◆   姓氏首字母H-K

　　◆   姓氏首字母L               ◆   姓氏首字母M-P

　　◆   姓氏首字母Q-V           ◆   姓氏首字母W

　　◆   姓氏首字母X-Y           ◆   姓氏首字母Z

　　生物物理所研究组长总名录

（资料来源：人事处，2020-12-02）